«Gérer le gène de l’obésité»

“Le gène” interrupteur principal “qui provoque l’obésité a été identifié”, a rapporté le Daily Mail. Il a déclaré que la percée pourrait aider à traiter “les maladies liées à l’obésité telles que les maladies cardiaques et le diabète”.

Cette étude génétique a examiné comment les variations génétiques associées aux changements dans l’activité d’un gène (appelé KLF14) avaient des effets secondaires sur l’activité d’un réseau de gènes impliqués dans le métabolisme. L’activité de ces gènes secondaires dans les cellules adipeuses était associée à l’indice de masse corporelle, à la glycémie et au taux de cholestérol, et à la mesure dans laquelle le système d’insuline contrôlait la glycémie.

Cette étude ne conduit pas immédiatement à de nouvelles options de traitement, mais montre que la génétique qui sous-tend les conditions métaboliques telles que l’obésité et le diabète est complexe. Les résultats mettent en évidence l’importance de regarder un réseau de gènes en interaction plutôt qu’un seul gène en isolement.

L’étude elle-même n’a pas examiné l’activité de ces gènes chez les personnes obèses et il est trop tôt pour dire si KLF14 est «le gène qui fait grossir».

D’autres études sont nécessaires pour comprendre comment ce réseau de gènes influe sur l’obésité et les maladies liées à l’obésité.

D’où vient l’histoire?

L’étude a été réalisée par des chercheurs du King’s College de Londres et de l’Université d’Oxford. Le financement a été fourni par le Wellcome Trust. L’étude a été publiée dans la revue scientifique à comité de lecture Nature.

Le Daily Mail et Daily Mirror ont couvert cette histoire. Ni l’un ni l’autre des journaux ne détaillent cette étude complexe et les deux ont trop simplifié les résultats. On pourrait avoir l’impression, à la lecture de ces articles, que le gène KLF14 est la principale cause de l’obésité, alors qu’il est vraisemblablement lié à de multiples facteurs génétiques et environnementaux.

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Il s’agissait d’une étude génétique portant sur la façon dont certaines variations génétiques associées au diabète de type 2 et aux taux de cholestérol dans le sang pourraient avoir un effet sur d’autres gènes liés au métabolisme.

Les messages permettant d’activer ou de désactiver les gènes peuvent provenir de régions de l’ADN proches du gène lui-même. C’est ce qu’on appelle la régulation cis. Les gènes peuvent également être activés par des régions d’ADN éloignées du gène, ce que l’on appelle la régulation trans.

Les chercheurs disent que des études d’association à l’échelle du génome ont montré que des variations génétiques proches d’un gène appelé KLF14 sont associées au diabète de type 2 et à la régulation du cholestérol. Le gène KLF14 code pour un type de protéine appelé facteur de transcription, qui régule l’activité de certains gènes cibles.

Dans cette étude, les chercheurs ont examiné la possibilité que ces variations génétiques proches de KLF14 puissent également avoir un effet sur l’activation d’autres gènes situés loin de KLF14.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Les chercheurs ont recueilli des échantillons de sang et de tissus de 856 jumelles d’origine européenne qui participaient à l’étude MuTHER (Multiple Tissue Human Expression Resource). Parmi ceux-ci, le génotype complet du génome et les profils d’expression des tissus adipeux (une mesure dont les gènes étaient actifs dans leurs cellules graisseuses et leur degré d’activité) étaient connus pour 776 femmes. Les participants avaient en moyenne 62 ans. Les femmes les plus âgées de l’étude étaient 87 et les plus jeunes 40.

Les chercheurs ont mené une série d’expériences pour déterminer si les variations génétiques proches du KLF14 (appelées SNP) pourraient affecter l’activation des gènes qui en sont éloignés, en ayant un effet sur KLF14.

Ils ont examiné s’il y avait une association entre un SNP en amont de KLF14 appelé rs4731702 et l’activité de 16 663 gènes dans la biopsie de la graisse. Ils ont ensuite concentré leur attention sur 10 gènes mis en évidence par cette analyse pour être régulés trans par KLF14. Ils ont ensuite essayé de tester ces résultats en répétant leur expérience dans un deuxième ensemble d’échantillons de tissus adipeux.

Les chercheurs ont effectué diverses évaluations de ces 10 gènes, en examinant si leur activité était associée à l’indice de masse corporelle (IMC), au taux de cholestérol, aux lipides, à la glycémie, à l’insuline et à la capacité de l’insuline à réguler la glycémie.

Quels ont été les résultats de base?

Les chercheurs ont découvert que la variation génétique (SNP) rs4731702, qui se trouve à proximité du gène KLF14 et dont on sait qu’elle influence l’activité de KLF14, est également associée à l’activité d’une gamme de gènes dans les tissus adipeux. Ces gènes éloignés du gène KLF14 sont potentiellement régulés par KLF14.

Ils se sont concentrés sur 10 gènes dans lesquels les niveaux d’activité étaient liés à rs4731702. En répétant leur expérience sur un deuxième ensemble d’échantillons de tissus adipeux, ils ont trouvé que sept de ces gènes présentaient toujours une association avec rs4731702. Les chercheurs suggèrent que rs4371702 est associé entre 3% et 7,8% de la variation d’activité de ces gènes régulés trans.

Lorsque les chercheurs ont examiné l’activité de ces 10 gènes régulés trans et les mesures liées à l’obésité dans la cohorte des femmes, ils ont constaté que:

six des gènes étaient associés à des niveaux d’IMC et de cholestérol

cinq étaient associés à des niveaux de graisse et d’insuline dans le sang

quatre étaient associés à la façon dont l’insuline pourrait réguler les niveaux de sucre dans le sang

deux étaient associés à des niveaux de glycémie

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

Les chercheurs ont dit que le gène KLF14 agit comme un régulateur trans transgénique de l’expression des gènes adipeux (gras) (activité) et que l’activité des gènes régulés par KLF14 de cette manière est associée aux changements métaboliques associés au risque de maladie.

Conclusion

Cette étude génétique a montré comment un changement de lettre unique dans la séquence d’ADN proche d’un gène peut être associé à des effets sur des gènes éloignés. La recherche a révélé qu’un tel changement de l’ADN en amont d’un gène appelé KLF14 non seulement affecté l’activité de ce gène, mais a également influencé d’autres gènes dans les tissus adipeux qui sont associés au métabolisme.

Lorsque l’on comprend la génétique complexe qui sous-tend la raison pour laquelle certaines personnes pourraient être plus susceptibles de développer des conditions métaboliques, cette étude souligne l’importance d’examiner les réseaux de gènes en interaction plutôt qu’un gène particulier isolé.

À ce stade, il est trop tôt pour dire si cette recherche mènera à des options de traitement pour les maladies liées à l’obésité. La recherche elle-même n’a pas regardé directement l’activité de ces gènes chez les personnes obèses, et cela devra être examiné pour une meilleure idée de la façon dont ils peuvent contribuer à l’obésité. D’autres études sont nécessaires pour mieux comprendre comment le réseau de gènes affecte le risque d’obésité et les maladies liées à l’obésité.